冬季大棚栽培由于通风条件差，温度低，湿度大，施肥要讲究科学，否则肥料利用率不高，有时还会出现肥害。
尽量不施碳铵
碳铵施用后会挥发出大量氨气，对蔬菜生长不利，但是碳铵是冬暖大棚蔬菜追肥的肥料，即使在5℃的土温时，也能转化分解被作物吸收利用，如果急需追施碳铵，施用时一定要注意深施，一般在离蔬菜根茎8-10厘米处开10厘米深的沟，撒施后用土盖严，可提高利用率10%-30%。
不宜多施用磷酸二铵
大棚蔬菜需要大量的氮和钾，需要磷比较少。比如说，茄子需要的氮磷钾之比为3∶1∶4，黄瓜为 3∶1∶10，番茄为6∶1∶12等。磷酸二铵含氮18%、含磷46%，不含钾，所以大棚不宜多施。另外应注意，磷酸二铵不得与草木灰等碱性肥料混合施用，以免引起氨的挥发，造成氨害。
磷肥不宜地面撒施
磷容易被土壤吸收固化，失去肥效，因此磷肥适合作基肥或在蔬菜前期集中施于根系密集的土壤中，一般在移栽行开8厘米深沟，撒入磷肥后覆土4-5厘米，然后在浅沟内移栽蔬菜，缩短磷肥与作物根的距离来弥补磷移动性小的弱点。
钾肥不要后期追施
蔬菜一般在开花前后需钾较多，以后逐渐减少，后期施用钾肥会造成钾的利用率下降，浪费肥料。
尿素不要表土浅施
蔬菜作物发育阶段对肥水需求比较多，提前追施深施比浅施提高利用率28%左右。追肥时开8-10厘米深沟，施后严密盖土，对株行距大的蔬菜可采用开穴深施，根据棚温隔5-7天浇水，使其在土壤中有充足的时间氨化，以利吸收利用。在蔬菜生长期间，还可用0.3%尿素溶液喷洒叶面，每7天1次，每亩用肥液75-100公斤，连喷2-3次即可。
含铁肥料不要施入土壤中
铁很容易被土壤固定转化成难溶性化合物而不能被作物吸收利用而失去肥效，因此在大棚施用铁肥尽量采用叶面喷施。可用0.1%-0.3%的铁元素均匀喷洒在蔬菜叶面上。同样的道理，冬季可叶面喷施蔬菜专用叶面肥。
